一千多年来，三塔经历了风雨剥蚀和多次强烈大地震，仍然巍然屹立，显示了我国古代劳动人民的智慧。明朝时的公元 1056年农历5月6日大理发生大地震，史籍载“城廓人庐尽圮，中塔(大塔)折裂如破竹，旬日复合，安然无莹。”后面两座小塔被震斜，至今斜立，蔚为奇观，而崇圣寺被震毁，十分可惜。
    2006年7月12日至14日大理崇圣寺三塔文化旅游区举行了崇圣寺开光大典系列文化活动。国内一流专家云集大理共同探讨佛教文化经大理传承流变；百余位海内外高僧大德(108位高僧大德：比较著名的有新加坡的惟俨法师、泰国的仁得上师、韩国的智冠长老、香港的觉光长老、澳门的健钊法师、台湾的星云大师、北京的一诚、圣辉、刀述仁、学诚等高僧大德) 齐聚崇圣寺共同祈祷世界和平,祖国统一,民族团结,风调雨顺,和和美美。只可惜我们来时只赶上了一个尾巴。
　　
　　        崇圣寺原在三塔之西，靠苍山一面，其山门距三塔主塔约120米；是南诏国第10代王劝丰右时（公元824—859年）所建，时为南诏国后期。南诏国中期崇佛之风兴起，到劝丰右时已达极胜，佛寺遍于云南内，有小寺3千，大寺8百。经南诏之后的大理国，佛教较南诏更为发展。因此，大理国就有“佛国”、“妙香国”之称。崇圣寺建成之后即为南诏国、大理国时期佛教活动的中心。崇圣寺所崇之“圣”为观音。当时，大理地区对观音崇拜极为胜行。
    崇圣寺及三塔历经千年沧桑和风雨剥蚀，建国后政府对三塔保护十分重视，经国家文物局批准，1978--1981年由中国文物研究所承担了维修工程的勘察、测绘、工程设计和施工技术指导工作。云南省文化厅主持对其进行大规模维修。这次维修中在千寻塔基座中发现了佛教文物600余件，其中有大量的佛像和写本佛经，其中有一尊金质观音像，重1135克，高24厘米，极为珍贵。这是迄今为止发现的南诏国和大理国时期文物中最为丰富的一批，价值极高，为中外所瞩目。这此发现，揭开了古代大理这个“佛国”的一道神秘面纱。
    三塔中的小塔在主塔之西，与主塔等距70米；南北对峙，相距97米。它们是五代时期大理国所建造的。两塔形制一样，都为10层，高42.4米，是一对八角形的砖塔。